La Biblioteca alberga varias colecciones de libros, documentos, y mapas, que son especiales porque son antiguos, escasos, o porque han pertenecido a personajes importantes. El acceso a estas colecciones está abierto al público interesado, según las políticas vigentes para su uso.

La Colección "José Cecilio del Valle"
La biblioteca privada de Don José Cecilio del Valle fue donada a la Universidad Francisco Marroquín en enero de 1986 por los herederos del prócer: Hilda Wever del Valle de Asturias, Rebeca del Valle Samayoa de Zabalza, Mercedes V. del Valle y el Doctor Bernardo del Valle. La colección completa estuvo alojada en el Teologado Salesiano hasta 1990. Actualmente se encuentra en el segundo nivel del edificio de la Biblioteca Ludwig von Mises en una sala acondicionada para su protección y uso.

El interés del Sabio Valle no se limitaba a un solo campo del conocimiento humano. La colección contiene 1800 obras editadas entre el siglo XVI al XIX, incluyendo a los principales economistas liberales, los clásicos, obras de derecho, literatura, historia, geografía, e historia natural, y más; en latín, francés, castellano, italiano, inglés y griego. Cada volumen es importante tanto por su contenido como por la belleza de las encuadernaciones de la época, las ilustraciones y las artes tipográficas empleadas en su impresión. También hay mapas de principios del siglo XIX, así como varios ejemplares de algunas publicaciones periódicas literarias y científicas.

Colección William H. Hutt
La viuda del economista estadounidense William H. Hutt donó su biblioteca personal a la Universidad Francisco Marroquín. Muchos de estos libros tienen anotaciones marginales de su antiguo propietario, especialmente las obras de Keynes. Indudablemente será de mucho beneficio a los estudiosos de la materia conocer los pensamientos inéditos del gran antikeynesiano.

Colección Carlos W. Elmenhorst
El señor Elmenhorst fue un ávido coleccionista de mapas y libros de viajes a la región centroamericana. Sus mapas, curados por Erika y Jens Bornholt, están en exhibición en los tres niveles de la Biblioteca, y sus libros están alojados en la sala de colecciones especiales.

Para mayor información sobre cómo consultar estas colecciones, consulte las políticas de uso correspondientes.